Planomonospora Sp. PM18 : Isolation and Taxonomy of New Actinobacterial Strain Isolated from Algerian Saharan Soil = Planomonospora Sp. PM18 : Isolement et Taxonomie d’une Nouvelle Souche d’Actinobactérie Isolée du Sol Saharien Algérie

Fawzia Chaabane Chaouch; Khaoula Bouznada; Noureddine Bouras; Samira Tata; Atika Meklat; Salim Mokrane; Lynda Lamari; Kemassi Abdellah; Florence Mathieu; Nasserdine Sabaou

doi:10.12816/0046017

Article Details

Planomonospora Sp. PM18 : Isolation and Taxonomy of New Actinobacterial Strain Isolated from Algerian Saharan Soil = Planomonospora Sp. PM18 : Isolement et Taxonomie d’une Nouvelle Souche d’Actinobactérie Isolée du Sol Saharien Algérie

Authors:

Fawzia Chaabane Chaouch | Khaoula Bouznada | Noureddine Bouras | Samira Tata | Atika Meklat | Salim Mokrane | Lynda Lamari | Kemassi Abdellah | Florence Mathieu | Nasserdine Sabaou

Publisher:

Kasdi Merbah University of Ouargla

Main Topics:

Life sciences

Journal:

Algerian Journal of Arid Environment 2016 Vol.6 Issue 2, pp.16-23

Document Type:

Article

Publication Date:

12/2016

Document Language:

English

Document ID (Org No.):

116594

Frequency:

Bi-Annual

pISSN:

21701318

DOI:

10.12816/0046017

Descriptors:

Keywords:

Abstract:

 Une souche d’actinobactérie, désignée PM18, est isolée d'un échantillon de sol saharien par la méthode de suspensions-dilutions sur milieu chitine-vitamines agar additionné de polymyxine, après un prétraitement de l'échantillon de sol à 120°C (chaleur sèche) pendant 1 h. La position taxonomique de cette souche est déterminée sur la base des caractéristiques morphologiques et physiologiques, ainsi que sur l’analyse phylogénétique après séquençage du gène codant pour l’ARNr 16S. La souche PM18 produit un mycélium du substrat ramifié et non fragmenté et un mycélium aérien portant des sporanges cylindriques monosporés disposés en une double rangée parallèle. Les sporangiospores sont mobiles. Les caractéristiques morphologiques de cette souche correspondent à ceux des membres du genre Planomonospora. L’appartenance à ce genre a été confirmée par l’analyse phylogénétique. L’alignement de la séquence de la souche PM18 a montré un pourcentage de similarité de 99,2% avec Planomonospora sphaerica JCM 9374T et 98,8% avec Planomonospora parontospora. sous espèce antibiotica JCM 3094T. En se basant sur les différences phénotypiques et sur sa position distincte dans l'arbre phylogénétique, la souche PM18 pourrait une nouvelle espèce du genre Planomonospora.

 An actinobacterial strain, designated PM18, was isolated from a Saharan soil sample by agar plate dilution method on chitin-vitamin agar supplemented with polymyxin after pretreatment of the soil sample at 120°C (dry heat) for 1 h. The taxonomic status of this strain was determined basis on morphological and physiological characteristics and phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequence. Strain PM18 developed an extensively branched and non-fragmented substrate mycelium. The isolate was characterized by the presence of cylindrical monosporous sporangia, which were produced only on the aerial mycelium. Sporangia were arranged closely in parallel double rows. The monosporous sporangia were motile. The morphological features of this isolate corresponded to those of members of the genus Planomonospora. Furthermore, phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequence revealed that strain PM18 is a member of the genus Planomonospora. The 16S rRNA gene sequence similarity showed that this strain was most closely related to Planomonospora sphaerica JCM 9374T (99.2%) and Planomonospora parontospora subsp. antibiotica JCM 3094T (98.8%). Based on phenotypic differences and the separate position of strain PM18 in the phylogenetic tree, this strain may be a representative of aputativenovel species in the genus Planomonospora.

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Planomonospora Sp. PM18 : Isolation and Taxonomy of New Actinobacterial Strain Isolated from Algerian Saharan Soil = Planomonospora Sp. PM18 : Isolement et Taxonomie d’une Nouvelle Souche d’Actinobactérie Isolée du Sol Saharien Algérie

Authors:

Fawzia Chaabane Chaouch | Khaoula Bouznada | Noureddine Bouras | Samira Tata | Atika Meklat | Salim Mokrane | Lynda Lamari | Kemassi Abdellah | Florence Mathieu | Nasserdine Sabaou

Publisher:

Kasdi Merbah University of Ouargla

Main Topics:

Life sciences

Journal:

Algerian Journal of Arid Environment 2016 Vol.6 Issue 2, pp.16-23

Document Type:

Article

Publication Date:

12/2016

Document Language:

English

Document ID (Org No.):

116594

Frequency:

Bi-Annual

pISSN:

21701318

DOI:

10.12816/0046017

Descriptors:

ACTINOMYCETALES

BACTERIA

TAXONOMY

SOIL

ALGERIA

Planomonospora

Actinobacteria

Taxonomy

Saharan Soil

Microbial Diversity

Planomonospora

Actinobactéries

Taxonomie

Sol Saharien

Diversité Microbienne

Issues

Article Details

Authors: Fawzia Chaabane Chaouch | Khaoula Bouznada | Noureddine Bouras | Samira Tata | Atika Meklat | Salim Mokrane | Lynda Lamari | Kemassi Abdellah | Florence Mathieu | Nasserdine Sabaou

Publisher: Kasdi Merbah University of Ouargla

Main Topics: Life sciences

Journal: Algerian Journal of Arid Environment 2016 Vol.6 Issue 2, pp.16-23

Document Type: Article

Publication Date: 12/2016

Document Language: English

Document ID (Org No.): 116594

Frequency: Bi-Annual

pISSN: 21701318

DOI: 10.12816/0046017

Descriptors:

Issues

Authors:

Fawzia Chaabane Chaouch | Khaoula Bouznada | Noureddine Bouras | Samira Tata | Atika Meklat | Salim Mokrane | Lynda Lamari | Kemassi Abdellah | Florence Mathieu | Nasserdine Sabaou

Publisher:

Kasdi Merbah University of Ouargla

Main Topics:

Life sciences

Journal:

Algerian Journal of Arid Environment 2016 Vol.6 Issue 2, pp.16-23

Document Type:

Article

Publication Date:

12/2016

Document Language:

English

Document ID (Org No.):

116594

Frequency:

Bi-Annual

pISSN:

21701318

DOI:

10.12816/0046017