RAPD Markers for the Detection of Common Smut Resistance Gene ( s ) in Inbred Lines of Maize ( Zea Mays L. )

Hamad , Younis Kh.; Wasfy , Emadeldin H.; Farag , Samia A.; Darweesh , Aziza K.

doi:10.4197/Met.23-1.3

Article Details

RAPD Markers for the Detection of Common Smut Resistance Gene ( s ) in Inbred Lines of Maize ( Zea Mays L. )

Authors:

Hamad , Younis Kh. | Wasfy , Emadeldin H. | Farag , Samia A. | Darweesh , Aziza K.

Publisher:

King Abdulaziz University : Scientific Publishing Centre

Main Topics:

Life sciences

Journal:

Journal of King Abdulaziz University: Metrology , Environment and Arid Land Agricultural Sciences 2012 Vol.23 Issue 1, pp.37-50

Document Type:

Article

Publication Date:

1/2012

Document Language:

English

Document ID (Org No.):

25862

Frequency:

Bi-Annual

eISSN:

16584287

pISSN:

13191039

DOI:

10.4197/Met.23-1.3

Descriptors:

Keywords:

Abstract:

 This study was conducted to develop the common smut resistance gene(s) associated DNA markers in some maize inbred lines and estimate the genetic diversity among the six maize inbred lines under investigation. Twenty RAPD random primers have been used to determine marker(s) between the resistant and susceptible corn plants. Results indicated that some distinct markers were observed in case of using some primers but with the most of other primers, no markers were observed. Two markers, in case of primer no. 4 (5- GTCCACACGG 3-), at 280 and 400 bps in case of resistant bulk, were detected. Five markers, in case of primer no.16 (5- TCGGCGATAG 3-), at 620 and 1200 bps in resistant bulk, were detected and also at 330, 400 and 890 bps in susceptible one. Moreover, two markers, in case of primer no. 19 (5- TTCCGAACCC 3-), one of them at 480 bp in resistant bulk and the second at 900 bp in susceptible one. One marker in inbred line GM 27at 280 bp and the other one in inbred line GM 30 at 400 bp were detected in resistant plants only. Four cluster groups were identified, however, the first included the inbred line G635, white; the second included two lines GM14 and GM27, white; the third included two lines GM1002 and GM 1021, yellow; the fourth cluster included only line GM30, white. Accordingly, the shortest genetic distance (highest similarity value) was detected between two white lines GM14 and GM27 (0.55). On the other hand, the highest genetic distance (lowest similarity value) was manifested between two lines; G635, white and GM1002, yellow (0.29).

 أجريت اختبارات الـ RAPD باستخدام 20 بادئ عشوائي لتحديد دليل أو أكثر للتفرقة بين نباتات الذرة المقاومة والقابلة للإصابة. حيث أجريت هذه الدراسات على ست سلالات نقيه، منها أربعة بيضاء وهي G635، وGM14، وGM27، وGM30 واثنان صفراء وهي GM 1002، وGM 1021، وقد ظهر عدد من الدلائل مع بعض البوادئ، ولم يظهر مع معظمها دلائل واضحة، فقد ظهر اثنين من هذه الدلائل مع البادئ رقم 4 (-3 GTCCACACGGـ-5) عند bp280 وعند 400bp في حالة المقاومة، وظهرت عدة دلائل مع البادئ رقم 16 ('TCGGCGATAG 3ـ '5) فظهرت عند 1200bp, 620bp في حالة المقاوم وعند 330bp، و400bp ، و890bp في حالة القابل للإصابة، كذلك ظهر دليلان مع البادئ رقم 19 ('TTCCGAACCC 3ـ'5) حيث ظهر دليل واحد عند 480bp في حالة المقاوم وعند 900bp في حالة القابل للإصابة. كذلك ظهر دليلان كما سبق مع TBr عند 280bp ، و400bp ، فقد ظهر marker في السلالة رقم (GM 27) عند280bp ، وفي السلالة رقم 4 (GM 30) عند 400bp، وذلك في النباتات المقاومة فقط دون القابلة للإصابة. كذلك أعطت 4 بوادئ عشوائية نتائج إيجابية مع DNA نبات الذرة وذلك لعمل clusteranalysis لمعرفة درجة قرابة هذه السلالات لبعضها، وذلك لاستخدامها في برامج التربية والمقاومة لفطر الـ U.maydis، وقد ظهرت أربعة مجموعات شملت الأولى منها السلالة البيضاء G635 وحدها، والثانية شملت السلالتين البيضاوين GM14، وGM 27، وشملت الثالثة السلالتين الصفراوين M 1002 وGM 1021 بينما شملت المجموعة الرابعة السلالة البيضاء GM 30 وحدها. يمكن ملاحظة من هذه النتائج ان أقصر مسافة جينية (أعلى قيمة تشابه) كانت بين السلالة البيضاء GM14 والسلالة البيضاء 27 GM ـ(0.55) بينما أطول مسافة جينية (أقل قيمة تشابه) كانت بين السلالة البيضاء G 635 والسلالة الصفراء GM 1002ـ(0.29).

Article Details

RAPD Markers for the Detection of Common Smut Resistance Gene ( s ) in Inbred Lines of Maize ( Zea Mays L. )

Authors:

Hamad , Younis Kh. | Wasfy , Emadeldin H. | Farag , Samia A. | Darweesh , Aziza K.

Publisher:

King Abdulaziz University : Scientific Publishing Centre

Main Topics:

Life sciences

Journal:

Journal of King Abdulaziz University: Metrology , Environment and Arid Land Agricultural Sciences 2012 Vol.23 Issue 1, pp.37-50

Document Type:

Article

Publication Date:

1/2012

Document Language:

English

Document ID (Org No.):

25862

Frequency:

Bi-Annual

eISSN:

16584287

pISSN:

13191039

DOI:

10.4197/Met.23-1.3

Descriptors:

SMUTS

GENES

INBRED LINES

GENETIC MARKERS

MAIZE

MILDEWS

EGYPT

Ustilago maydis

Zea mays

RAPD

resistance genes

inbred lines.

Issues

Article Details

Authors: Hamad , Younis Kh. | Wasfy , Emadeldin H. | Farag , Samia A. | Darweesh , Aziza K.

Publisher: King Abdulaziz University : Scientific Publishing Centre

Main Topics: Life sciences

Journal: Journal of King Abdulaziz University: Metrology , Environment and Arid Land Agricultural Sciences 2012 Vol.23 Issue 1, pp.37-50

Document Type: Article

Publication Date: 1/2012

Document Language: English

Document ID (Org No.): 25862

Frequency: Bi-Annual

eISSN: 16584287

pISSN: 13191039

DOI: 10.4197/Met.23-1.3

Descriptors:

Issues

Authors:

Hamad , Younis Kh. | Wasfy , Emadeldin H. | Farag , Samia A. | Darweesh , Aziza K.

Publisher:

King Abdulaziz University : Scientific Publishing Centre

Main Topics:

Life sciences

Journal:

Journal of King Abdulaziz University: Metrology , Environment and Arid Land Agricultural Sciences 2012 Vol.23 Issue 1, pp.37-50

Document Type:

Article

Publication Date:

1/2012

Document Language:

English

Document ID (Org No.):

25862

Frequency:

Bi-Annual

eISSN:

16584287

pISSN:

13191039

DOI:

10.4197/Met.23-1.3