Kuşburnu sıcak su kaynağından yeni termo-alkalofilik Anoxybacillus sp. KB4 şusunun izolasyonu ve  tanımlanması

Fatma MATPAN BEKLER

Article Details

Kuşburnu sıcak su kaynağından yeni termo-alkalofilik Anoxybacillus sp. KB4 şusunun izolasyonu ve tanımlanması

Authors:

Fatma MATPAN BEKLER

Publisher:

Ersin YÜCEL

Journal:

Biological Diversity and Conservation 2016 Vol.9 Issue 2, pp.169-179

Document Type:

Article

Publication Date:

8/2016

Document Language:

Turkish

Document ID (Org No.):

2000893148

Frequency:

Tri-annual

eISSN:

1308-8084

pISSN:

1308-5301

Keywords:

Abstract:

 

Thermophiles are able to grow at temperatures up to 110°C and at different pH  thermo-acidophiles and thermo-alkalophiles  and they are an interesting source of biotechnological applications. The aim of this study was to isolate thermophilic bacterium from Kuşburnu hot water spring in the town of Diyadin in Turkey. The thermophilic strain KB4 was identified by morphological, physiological, biochemical tests and 16S rRNA gene sequencing. Strain KB4 was found to be an aerobic, Gram-positive, rod shaped, motile and yellow-pigmented. Optimal growth was obtained at pH 9.0–10.0, at 55-60 oC, and at 3%  w/v  NaCl. Potantial of different carbon and nitrogen sources utilization were examined. The strain KB4 was able to utilize some carbon and nitrogen sources, including glucose, galactose, sucrose, maltose, arabinose, xylose, yeast extract, peptone, tryptone and casamino acids. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences showed that isolate KB4 was most closely related to Anoxybacillus pushchinoensis K1  T  with a 98.78% sequence similarity. In addition, this study will be a guiding study in determining the diversity of thermophilic bacteria from geothermal waters of Turkey.

 

Termofiller 110 oC’ye kadar sıcaklıklarda ve farklı pH’larda  termo-asidofil ve termo-alkalofil  büyüyebilme yeteneğine sahiptirler ve biyoteknolojik uygulamaların ilgi çeken bir kaynağıdırlar. Bu çalışmanın amacı, Türkiye’deki Diyadin ilçesi Kuşburnu sıcak su kaynağından termofilik bakteri izole etmektir. KB4 suşu, morfolojik, fizyolojik, biyokimyasal testler ve 16S rRNA gen sekanslamayla tanımlanmıştır. KB4 suşu, aerobik, Gram-pozitif, çubuk şeklinde, hareketli ve sarı pigmentli olarak bulunmuştur. Optimum üreme pH 9.0-10.0’da, 55-60 oC’de ve %3  w/v  NaCl konsantrasyonunda elde edilmiştir. Farklı karbon ve azot kaynaklarının kullanımı denendi. KB4 suşu, glukoz, galaktoz, sükroz, maltoz, arabinoz, ksiloz, yeast ekstrakt, pepton, tripton ve casamino asit gibi bazı karbon ve azot kaynaklarını kullanabilmektedir. 16S rRNA gen sekansına bağlı filogenetik analizler KB4 suşunun %98.78 sekans benzerliği ile Anoxybacillus pushchinoensis K1 T ’e oldukça yakın olduğu göstermektedir. Ek olarak, bu çalışma Türkiyede’ki jeothermal sulardan termofilik bakterilerin çeşitliliğini belirlemede rehber olacaktır.

Article Details

Kuşburnu sıcak su kaynağından yeni termo-alkalofilik Anoxybacillus sp. KB4 şusunun izolasyonu ve tanımlanması

Authors:

Fatma MATPAN BEKLER

Publisher:

Ersin YÜCEL

Journal:

Biological Diversity and Conservation 2016 Vol.9 Issue 2, pp.169-179

Document Type:

Article

Publication Date:

8/2016

Document Language:

Turkish

Document ID (Org No.):

2000893148

Frequency:

Tri-annual

eISSN:

1308-8084

pISSN:

1308-5301

Anoxybacillus

izolasyon

tanımlama

termofilik

16S rRNA geni

Issues

Article Details

Kuşburnu sıcak su kaynağından yeni termo-alkalofilik Anoxybacillus sp. KB4 şusunun izolasyonu ve tanımlanması

Authors: Fatma MATPAN BEKLER

Publisher: Ersin YÜCEL

Journal: Biological Diversity and Conservation 2016 Vol.9 Issue 2, pp.169-179

Document Type: Article

Publication Date: 8/2016

Document Language: Turkish

Document ID (Org No.): 2000893148

Frequency: Tri-annual

eISSN: 1308-8084

pISSN: 1308-5301

Anoxybacillus

izolasyon

tanımlama

termofilik

16S rRNA geni

Issues

Authors:

Fatma MATPAN BEKLER

Publisher:

Ersin YÜCEL

Journal:

Biological Diversity and Conservation 2016 Vol.9 Issue 2, pp.169-179

Document Type:

Article

Publication Date:

8/2016

Document Language:

Turkish

Document ID (Org No.):

2000893148

Frequency:

Tri-annual

eISSN:

1308-8084

pISSN:

1308-5301