SSR Markörlerinin Mercimek Genom Haritalamasında Kullanılması

Abdullah KAHRAMAN; Ümran Akgün YILDIRIM; Melike BAKIR

Article Details

SSR Markörlerinin Mercimek Genom Haritalamasında Kullanılması

Authors:

Abdullah KAHRAMAN | Ümran Akgün YILDIRIM | Melike BAKIR

Publisher:

Adıyaman University

Journal:

Journal of ADYUTAYAM 2019 Vol.7 Issue 1, pp.14-22

Document Type:

Article

Publication Date:

5/2019

Document Language:

Turkish

Document ID (Org No.):

2000842516

Frequency:

Bi-Annual

pISSN:

2667-4092

Keywords:

Abstract:

 

The objective of this study was to integrate the SSR  Simple sequence Repeats  markers in lentil  Lens culinaris Medik.  genetic linkage map. To construct the linkage map, an F6 derived Recombinant inbreed line  RIL  population with 93 lines developed from the cross of WA8649041 x Precoz was used. Linkage map was comprised of RAPD, ISSR, AFLP, ISSR and morphological markers. One hundred seventy five  175  SSR markers were used in the study. 25 SSR markers were polymorphic, while 109 SSR markers were monomorphic and 41 SSR markers did not work. SSR markers were distributed in different linkage groups rather than clustering in some linkage groups. Of the 21 SSR markers, 13 of them were mapped in lentil genome and the current genetic linkage map is comprised of 136 markers including 57 AFLP, 48 RAPD, 16 ISSR, 2 morphological and 13 SSR markers. Genetic linkage map is comprised of 11 linkage groups with 1311.2 cM in length and average genetic distance between two markers is 9.64 cM.

 

Bu çalışmada, mercimek  Lens culinaris Medik.  bitkisinin genomuna ait bağlantı  linkaj  haritasına SSR  Simple Sequence Repeats  markörlerinin katılımı amaçlanmıştır. Genom haritası oluşturulmasında WA8649041 ve Precoz ebeveynlerin çaprazlanmasıyla elde edilen 93 adet rekombinant saf hat  Rekombinant Inbred Lines, RILs  populasyonu kullanılmıştır. Çalışmada 175 SSR primeri kullanılmış, bu primerlerden 25 adedi polimorfik, 109 adedi monomorfik, 41 adedi çalışmamıştır. Polimorfik olduğu tespit edilen SSR markörlerinden, 13 adedi haritalanmış, haritalanan markörler, genetik bağlantı haritasında belirli bir kromozom veya grupta toplanmayıp farklı bağlantı gruplarına dağılmıştır. Hali hazırda mevcut 123 markörden oluşan genom haritasına  57 AFLP, 48 RAPD, 16 ISSR ve 2 morfolojik markör , bu çalışmayla 13 SSR markör ilave edilerek genom haritasındaki toplam markör sayısı 136 olmuştur. Genom haritası 11 bağlantı  linkaj  grubundan oluşmuş, toplam harita uzunluğu 1311.2 cM ve iki markör arası ortalama uzunluk 9.64 cM olarak belirlenmiştir.

Article Details

SSR Markörlerinin Mercimek Genom Haritalamasında Kullanılması

Authors:

Abdullah KAHRAMAN | Ümran Akgün YILDIRIM | Melike BAKIR

Publisher:

Adıyaman University

Journal:

Journal of ADYUTAYAM 2019 Vol.7 Issue 1, pp.14-22

Document Type:

Article

Publication Date:

5/2019

Document Language:

Turkish

Document ID (Org No.):

2000842516

Frequency:

Bi-Annual

pISSN:

2667-4092

Mercimek

Moleküler Markör

SSR Basit Dizi Tekrarları

RIL Rekombinant

Issues

Article Details

SSR Markörlerinin Mercimek Genom Haritalamasında Kullanılması

Authors: Abdullah KAHRAMAN | Ümran Akgün YILDIRIM | Melike BAKIR

Publisher: Adıyaman University

Journal: Journal of ADYUTAYAM 2019 Vol.7 Issue 1, pp.14-22

Document Type: Article

Publication Date: 5/2019

Document Language: Turkish

Document ID (Org No.): 2000842516

Frequency: Bi-Annual

pISSN: 2667-4092

Mercimek

Moleküler Markör

SSR Basit Dizi Tekrarları

RIL Rekombinant

Issues

Authors:

Abdullah KAHRAMAN | Ümran Akgün YILDIRIM | Melike BAKIR

Publisher:

Adıyaman University

Journal:

Journal of ADYUTAYAM 2019 Vol.7 Issue 1, pp.14-22

Document Type:

Article

Publication Date:

5/2019

Document Language:

Turkish

Document ID (Org No.):

2000842516

Frequency:

Bi-Annual

pISSN:

2667-4092